Die Kirchgemeinde Egolzwil-Wauwil ist eine öffentlich-rechtliche Körperschaft mit eigener Rechtspersönlichkeit und untersteht der Staatsverfassung, dem öffentlichen Recht und dem Recht der Landeskirche. Die Kirchgemeinde ist im Rahmen der landeskirchlichen und staatlichen Vorschriften autonom.
§ 8 Kirchenverfassung

Die Organe unserer Kirchgemeinde sind: die Stimmberechtigten (2020: 2‘400), der Kirchenrat und die Rechnungskommission (3 Mitglieder). Der Kirchenrat ist die verwaltende und vollziehende Behörde, untersteht der Aufsicht der kantonalen Landeskirche und besteht aus 6 Mitgliedern plus von amteswegen dem Pfarradministrator, Andreas Barna. Die Mitglieder des Kirchenrates, der Präsident und der Kirchmeier werden alle 4 Jahre neu gewählt, letztmals im 2018. Jedes Mitglied des Kirchenrates hat einen Aufgabenbereich zu betreuen.

Zum Pfarreiteam gehören der Pfarradministrator Andreas Barna, die Pfarreiseelsorgerin Doris Zemp, die Pfarreisekretärin Marie-Theres Helfenstein, die Sakristaninnen, die Lektorinnen und die Chorleiterin.